PAFI didirikan oleh sejumlah tokoh penting di bidang farmasi yang menyadari pentingnya pembentukan organisasi profesional yang terstruktur. Beberapa nama penting yang terlibat dalam pendirian PAFI adalah Dr.PAFI juga terlibat dalam advokasi untuk kebijakan kesehatan yang lebih baik di Indonesia. Organisasi ini bekerja sama dengan pemerintah, lembag